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科研人员解析斑鳖的全基因组序列:其与中华鳖亲缘关系密切

2022-05-12 15:51:00  来源:网络  阅读量:19768   

记者12日从中国科学院昆明动物研究所获悉,该所与长沙生态动物园合作,成功组装了世界最濒危龟类物种中华鳖的高质量参考基因组序列,并分析了其适应性进化基础。研究人员发现,中华鳖(Trionyx sinensis)与中华鳖(Trionyx sinensis)亲缘关系很近,但它们在5440万年前分道扬镳。

为了避免雌性中华鳖基因组遗传信息的永久丢失,促进中华鳖的调查和保护,在长沙生态动物园的支持下,研究人员在病理解剖检查中采集了死亡雌性中华鳖的组织样本。通过结合相关测序数据,研究人员成功地在这个个体的染色体水平上组装了一个高质量的参考基因组序列。

基于多种数据集和进化树构建算法,研究人员发现中华鳖和中华鳖亲缘关系很近,但在5440万年前分道扬镳。种群历史分析表明,历史上中华鳖的有效种群一直在持续下降,这与其较低的遗传杂合度和遗传多样性是一致的。比较基因组学分析表明,一些与自噬、DNA损伤反应和生长相关的核心基因具有正向选择或快速进化,提示它们在龟的长寿和大体型过程中具有重要作用。此外,研究人员发现,乌龟的基因组中缺失了一些与牙齿形成相关的基因,这部分解释了它们无齿表型的遗传基础。

中华鳖全基因组遗传信息的分析不仅保存了该物种的全基因组信息,而且对今后中华鳖的野外调查、搜寻和保护具有重要意义。

相关研究成果近日发表在国际期刊《分子生态学资源》上。

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